ΑΝΑΤΟΜΙΑ ΤΟΥ Κ.Ν.Σ. – ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΗ ΟΡΓΑΝΩΣΗ ΤΟΥ ΕΓΚΕΦΑΛΟΥ, Μέρος Β, 2017/2018531

Μάθημα του Διατμηματικό ΠΜΣ στα Προηγμένα Συστήματα Υπολογιστών και Επικοινωνιών  με κατεύθυνση Ευφυή Συστήματα – Μεθοδολογίες Υπολογιστικής Νοημοσύνης και Εφαρμογές”,  

Διδάσκων:
Καθηγητής Δημήτρης Κουγιουμτζής

Για να δείς ή να εκτυπώσεις τα παρακάτω αρχεία (σημειώσεις και διαφάνειες), χρειάζεσαι το πρόγραμμα acrobat reader, το οποίο δεν είναι εμπορικό. Για να το εγκαταστήσεις, αν δεν το έχεις, πάνε στο http://www.adobe.com/products/acrobat/readstep.html

Ενότητες:

Περιεχόμενα - Βιβλιογραφία

Περιεχόμενα
1. Υπολογιστικές νευροεπιστήμες, εισαγωγή
2. Ηλεκτροεγκεφαλογράφημα, παράσιτα, φίλτρα, 
3. Φασματική ανάλυση
4. Ανάλυση συνδεσιμότητας εγκεφάλου

Βιβλιογραφία
1. Schomer D. L., da Silva F. L. (eds) (2018) Niedermeyer's Electroencephalography: Basic Principles, Clinical Applications, and Related Fields, 7th Edition, Oxford University Press.

2. Tong S. and Thakor N.V (eds) (2009) Quantitative EEG Analysis Methods and Clinical Applications, Artech House.

 

 Σημειώσεις

Δεν είναι ακόμα διαθέσιμες.

 Διαφάνειες

Διαφάνειες διδασκαλίας για το Μέρος Β

  1. Μάθημα 1, 17/4/2018
    Ηλεκτροεγκεφαλογράφημα και επιληψία, διάλεξη του Αν. Καθ. Τμήματος Ιατρικής ΑΠΘ Κιμισκίδη Βασίλη 

  2. Μάθημα 2, 8/5/2018, 17:15-19:00 
    Computational Neuroscience - 1 (σε PDF) [τελευταία ενημέρωση 8/5/2018]
    Αναλυτικά
    -- Σύντομη εισαγωγή στις υπολογιστικές νευροεπιστήμες
    -- Μέτρηση σημάτων εγκεφάλου
    -- Μέθοδοι καταγραφής ηλεκτροεγκεφαλογραφήματος (ΗΕΓ)
    -- Μέθοδοι αναφοράς ΗΕΓ
    -- Ασκήσεις


  3. Μάθημα 3, 15/5/2018, 17:15-19:00 
    Computational Neuroscience - 2 (σε PDF) [τελευταία ενημέρωση 15/5/2018]
    Αναλυτικά
    -- Παράσιτα στο ΗΕΓ
    -- Εντοπισμός και απόρριψη παρασίτων
    -- Ανάλυση στο πεδίο του χρόνου - συχνότητας
    -- Ασκήσεις
     

  4. Μάθημα 4, 22/5/2018, 17:15-19:00 
    Computational Neuroscience - 3 (σε PDF) [τελευταία ενημέρωση 22/5/2018]
    Αναλυτικά
    -- Εισαγωγή στην ανάλυση μονο-κάναλου ΗΕΓ
    -- Χαρακτηριστικά της μορφολογίας του σήματος
    -- Χαρακτηριστικά από γραμμική ανάλυση
    -- Χαρακτηριστικά από μη-γραμμική ανάλυση
    -- Ασκήσεις

  5. Μάθημα 5, 29/5/2018, 17:15-19:00 
    Computational Neuroscience - 4 (σε PDF) [τελευταία ενημέρωση 29/5/2018]
    Αναλυτικά
    -- Εισαγωγή στη μελέτη δικτύων συνδεσιμότητας του εγκεφάλου από πολυ-κάναλα ΗΕΓ
    -- Μέτρα συσχέτισης στο πεδίο του χρόνου και της συχνότητας
    -- Δίκτυα συσχέτισης
    -- Ασκήσεις

  6. Μάθημα 6, 5/6/2018, 17:15-19:00 
    Computational Neuroscience - 5 (σε PDF) [τελευταία ενημέρωση 29/5/2018]
    Αναλυτικά
    -- Λειτουργική συνδεσιμότητα στο πεδίο του χρόνου και της συχνότητας
    -- Δίκτυα συνδεσιμότητας
    -- Ασκήσεις
      

Προγράμματα και δεδομένα

Προγράμματα

Συναρτήσεις και προγράμματα στο υπολογιστικό περιβάλλον Matlab.

Θα χρησιμοποιηθεί το πακέτο eeglab σε περιβάλλον Matlab, που μπορεί να φορτωθεί από τη διεύθυνση https://sccn.ucsd.edu/eeglab/downloadtoolbox.php

Εναλλακτικά μπορείς να πάρεις το συμπιεσμένο αρχείο για το eeglab, έκδοση 4.1, eeglab.rar

Θα χρησιμοποιηθεί το πακέτο MATS σε περιβάλλον Matlab, που μπορεί να φορτωθεί από τη διεύθυνση http://eeganalysis.web.auth.gr/ (επιλογή Software)

Θα χρησιμοποιηθούν προγράμματα σε περιβάλλον Matlab για ανάλυση πολυ-κάναλων ΗΕΓ, που είναι σε ένα φάκελο στο συμπιεσμένο αρχείο MatlabLinearConnectivity.zip . Ο φάκελος περιέχει και ένα αρχείο πολυ-κάναλων ΗΕΓ σε επιληπτική κρίση.

Δεδομένα

1. Καταγραφή εξωκρανιακού ΗΕΓ με επιληπτική κρίση μεγάλης διάρκειας (περίπου 4 ώρες), αρχείο A.edf και σύντομη περγραφή του Ainfo.txt (δες επίσης http://eeganalysis.web.auth.gr/ και επιλογή Data).

2. Καταγραφή εξωκρανιακού ΗΕΓ με επιληπτική κρίση μικρής διάρκειας (15 λεπτά), αρχείο Epi.dat και σύντομη περγραφή του Epiinfo.txt. Δίνονται επίσης οι τοποθεσίες των καναλιών στο αρχείο Standard-10-20-Cap25Reordered.ced

Εργασία φοιτητών

Η παρουσίαση των εργασιών θα γίνει την Παρασκευή  29/6/2018 στις 18:00 στό Εργαστήριο Πληροφορικής (ισόγειο τρίτης πτέρυγας). Θα πρέπει η κάθε ομάδα να έχει μαζί της σε φλασάκι την παρουσίαση και θα πρέπει επίσης την ίδια μέρα να στείλει την παρουσίαση (και όποια άλλα αρχεία ζητούνται) στον διδάσκοντα, e-mail: dkugiu@auth.gr

Η εργασία για το δεύτερο μέρος του μαθήματος δίνεται εδώ. Τα δεδομένα για την ανάλυση με σχετικές πληροφορίες (δες περιγραφή της εργασίας) δίνονται στον παρακάτω πίνακα.

Ομάδα Καταγραφή 1 Καταγραφή 2 Α/Α TMS για 1 Α/Α TMS για 2
1 C1TMSEEG1 C1TMSEEG2 3 4 5 6 7 5 6 7 8 9
2 C2TMSEEG1 C2TMSEEG2 10 12 13 14 15 11 12 13 14 15
3 C3TMSEEG1 C3TMSEEG2 10 11 12 13 14 2 3 4 5 6
4 C4TMSEEG1 C4TMSEEG2 5 6 7 8 9 3 4 5 6 10
5 C5TMSEEG1 C5TMSEEG2 1 3 4 5 6 6 7 8 9 11
6 C6TMSEEG1 C6TMSEEG2 10 11 12 13 14 11 12 13 14 15
7 C7TMSEEG1 C7TMSEEG2 15 16 17 18 19 20 10 11 12 13 14 15

Θα σχηματιστούν ομάδες το πολύ δύο ατόμων. Ένα μέλος της κάθε ομάδας θα στείλει ηλεκτρονικό μήνυμα στο διδάσκοντα δίνοντας τα στοιχεία των μελών της ομάδας (ονοματεπώνυμο, ιδρυματικό e-mail, ΑΕΜ). Ο διδάσκων θα απαντήσει με υπόδειξη για την ανάκτηση των δεδομένων.

Οι ομάδες δίνονται στον παρακάτω πίνακα.

Ομάδα Ονοματεπώνυμο ΑΕΜ e-mail
1 Παυσανίας Κακαρίνος 387 pkakarin@ece.auth.gr
  Ιωάννης Κατσικαβέλας 361 katsikave@ece.auth.gr
2 Μπίσμπας Γεώργιος 394 gmpismpas@auth.gr
  Σκούφας Κωνσταντίνος 400 skoukons@auth.gr
3 Ειρήνη-Μαρία Ταμπάκη 401 etampaki@ece.auth.gr
  Ιωάννα Πασιοπούλου 396 ipasiopou@ece.auth.gr
4 Κεσκιλίδου Αλίκη  390 alikesdim@ece.auth.gr
  Καραίσκου Σοφία 388 skaraiskou@ece.auth.gr
5 Νούσιας Χρυσόστομος 406 xnousias@ece.auth.gr
  Ροδίτης Παναγιώτης 398 proditis@ece.auth.gr
6 Αριστείδης Καρατζούνης 389 karisteia@ece.auth.gr
  Βασίλειος Τόλης 402 tolisvasil@ece.auth.gr
7 ΖΑΧΑΡΙΑΣ ΤΣΟΥΡΑΛΑΚΗΣ 404 zachtsou@ece.auth.gr

 

Βαθμολογία Μαθήματος

Η βαθμολογία για το Β' μέρος του μαθήματος θα δοθεί με βάση την εργασία, την παρουσίαση της εργασίας και τη συμμετοχή του/της κάθε φοιτητή/τριας στις παρουσιάσεις.


Ενημερώθηκε στις 26/6/2018 από τον Κουγιουμτζή Δημήτρη E-MAIL dkugiu@auth.gr